بررسی امکان کلونینگ قطعه آنتی ژنیک پیش گویی شده توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیکی آنزیم هیالورونیداز استرپتوکوکوس پایوژن

سابقه و هدف: از مشکلات جدی در تولید آنزیم هیالورونیداز استرپتوکوکوس پایوژنز به صورت نوترکیب، وزن مولکولی بالای این پروتئین می باشد. هدف از انجام این مطالعه استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی جهت پیش بینی نواحی با بیش ترین خاصیت آنتی ژنیک در پروتئین هیالورونیداز، پیش گویی ساختار قطعه مورد نظر و ارزیابی کلونینگ آن در وکتور ptz57r/t می باشد. مواد و روش ها: ابتدا جهت به دست آوردن توالی مورد توافق در تمامی توالی های آمینو اسیدی آنزیم هیالورونیداز، هم ترازی چند گانه با استفاده از نرم افزار megalign و روش clustal w صورت پذیرفت. آنالیز blasp صورت پذیرفت. نواحی آنتی ژنیک با استفاده از نرم افزارهای آنلاین abcpred، bcepred و emboss تعیین گردید. ساختمان سه بعدی نواحی آنتی ژنیک تعیین شده، با استفاده از نرم افزار taseri پیش گویی شد و با استفاده از نرم افزار swiss-pdb viewer بررسی گردید. در نهایت قطعه پیش بینی شده در وکتور ptz57r/t وارد گردید. یافته ها: توالی مورد توافق به دست آمده دارای 868 آمینو اسید بود که توالی امینو اسیدی 279 تا 773 به عنوان منطقه با آنتی ژنیک بالا به منظور کوتاه کردن توالی با استفاده از نرم افزارهای آنلاین انتخاب شد. در نهایت نتایج نشان داد که بخش های آنتی ژنیک ژن هیالورونیداز در وکتور ptz57r/t کلون شده است.  نتیجه گیری: توالی مورد توافق به دست آمده دارای 868 آمینو اسید بود که توالی امینو اسیدی 279 تا 773 به عنوان منطقه با آنتی ژنیک بالا به منظور کوتاه کردن توالی با استفاده از نرم افزارهای آنلاین انتخاب شد. در نهایت نتایج نشان داد که بخش های آنتی ژنیک ژن هیالورونیداز در وکتور ptz57r/t کلون شده است